[合集]C跟W是什么意思 ？               

发信人: kingsyl (Molecular Machine To Be Studied), 信区: Bioinformatics
标  题: [合集]C跟W是什么意思 ？
发信站: 北大未名站 (2004年03月21日20:12:15 星期天), 站内信件

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作者  lylover (阅读R文档ing&思念cinderella), 信区: Bioinformatics            
标题  C跟W是什么意思？                                                       
时间  北大未名站 (2003年10月21日21:56:17 星期二), 转信                       
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处理SGd时候看到的，比如：YBR108C与YBR108W，这个C跟W什么关系？who tell me?

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作者  kingsyl (苦学中，勿扰！-_-~谢谢), 信区: Bioinformatics                 
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月21日23:05:47 星期二), 站内信件                   
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I guess it is residue name by mutation.

【 在 lylover (阅读R文档ing&思念cinderella) 的大作中提到: 】
: 处理SGd时候看到的，比如：YBR108C与YBR108W，这个C跟W什么关系？who tell me?

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作者  Auction (御风而行), 信区: Bioinformatics                               
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日08:57:22 星期三), 转信                       
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Crick and Watson
也就是DNA的两条链。
【 在 lylover (阅读R文档ing&思念cinderella) 的大作中提到: 】
: 处理SGd时候看到的，比如：YBR108C与YBR108W，这个C跟W什么关系？who tell me?

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作者  kokolu (岁月如歌), 信区: Bioinformatics                                
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日10:09:36 星期三), 转信                       
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那哪一条定义成C，哪一条定义成W哪？

【 在 Auction (御风而行) 的大作中提到: 】
: Crick and Watson
: 也就是DNA的两条链。

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作者  Auction (御风而行), 信区: Bioinformatics                               
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日10:38:39 星期三), 转信                       
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xixi,这个倒是忘了，
好象是根据长臂短臂来分的。
【 在 kokolu (岁月如歌) 的大作中提到: 】
: 那哪一条定义成C，哪一条定义成W哪？

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作者  Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了), 信区: Bioinformatics               
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日10:51:22 星期三), 转信                       
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啊？不会吧？长臂短臂和双链没什么关系吧？

【 在 Auction (御风而行) 的大作中提到: 】
: xixi,这个倒是忘了，
: 好象是根据长臂短臂来分的。

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作者  Auction (御风而行), 信区: Bioinformatics                               
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日11:37:39 星期三), 转信                       
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一条链从长臂开始，而另外一条链从短臂开始。
【 在 Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了) 的大作中提到: 】
: 啊？不会吧？长臂短臂和双链没什么关系吧？

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作者  lylover (阅读R文档ing&思念cinderella), 信区: Bioinformatics            
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日15:36:44 星期三), 转信                       
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是啊，总不至于watson和crick两人先比比谁的胳膊长，然后再确定C和W？哈哈。
【 在 Feynman (早知道等下辈子再做帅哥了) 的大作中提到: 】
啊？不会吧？长臂短臂和双链没什么关系吧？

【 在 Auction (御风而行) 的大作中提到: 】
: xixi,这个倒是忘了，
: 好象是根据长臂短臂来分的。

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作者  Auction (御风而行), 信区: Bioinformatics                               
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日16:02:03 星期三), 转信                       
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ft亚ft
DNA可是被着丝点分成两条臂的亚。
【 在 lylover (阅读R文档ing&思念cinderella) 的大作中提到: 】
: 是啊，总不至于watson和crick两人先比比谁的胳膊长，然后再确定C和W？哈哈。
: 啊？不会吧？长臂短臂和双链没什么关系吧？

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作者  Auction (御风而行), 信区: Bioinformatics                               
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日16:03:36 星期三), 转信                       
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我那时候也是疑惑ORF
的命名方式
专门到图书馆看了97年yeast测序的那片文章

【 在 lylover (阅读R文档ing&思念cinderella) 的大作中提到: 】
: 是啊，总不至于watson和crick两人先比比谁的胳膊长，然后再确定C和W？哈哈。
: 啊？不会吧？长臂短臂和双链没什么关系吧？

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作者  kokolu (岁月如歌), 信区: Bioinformatics                                
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日16:22:17 星期三), 转信                       
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原来还有如此的典故啊。
【 在 Auction (御风而行) 的大作中提到: 】
: 一条链从长臂开始，而另外一条链从短臂开始。

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作者  lylover (阅读R文档ing&思念cinderella), 信区: Bioinformatics            
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月22日17:35:57 星期三), 转信                       
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能不能解释一下怎么分的？
长臂的C还是短臂C？有一点不清楚。

【 在 Auction (御风而行) 的大作中提到: 】
xixi,这个倒是忘了，
好象是根据长臂短臂来分的。
【 在 kokolu (岁月如歌) 的大作中提到: 】
: 那哪一条定义成C，哪一条定义成W哪？

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作者  Auction (御风而行), 信区: Bioinformatics                               
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月23日09:30:34 星期四), 转信                       
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还是从stanford的网站上面找到解释
ORF naming conventions (Yeast)
All S. cerevisiae ORF's are designated by a symbol consisting of three
uppercase letters followed by a number and then another letter, as follows:
Y (for "Yeast"); A - P for the chromosome upon which the ORF resides (where
"A" is chromosome I, up to "P" for chromosome XVI); L or R (for Left or
Right arm); a 3-digit number corresponding to the order of the open reading
frame on the chromosome arm (starting from the centromere and counting out
to the telomere); and W or C for whether the open reading frame is on the
"Watson" or "Crick" strand (where "Watson" runs 5' to 3' from left telomere
to right telomere). Most ORF designations by the systematic sequencing
groups use a predicted 100 amino acid polypeptide as the minimum size limit,
except when a smaller gene has already been characterized and localized to
the chromosomal sequence. When a new ORF is discovered on a chromosome that
has already had its ORF's named, the new ORF will usually be named by taking
the name of an adjacent ORF and adding an "A" or "B" to the end of it (this
avoids re-numbering all the distal ORF's).
【 在 lylover (阅读R文档ing&思念cinderella) 的大作中提到: 】
: 能不能解释一下怎么分的？
: 长臂的C还是短臂C？有一点不清楚。
: xixi,这个倒是忘了，
: 好象是根据长臂短臂来分的。

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作者  lylover (阅读R文档ing&思念cinderella), 信区: Bioinformatics            
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月23日15:35:04 星期四), 转信                       
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watson是从左向右，crick是从右向左了/hehe .

【 在 Auction (御风而行) 的大作中提到: 】
: 还是从stanford的网站上面找到解释
: ORF naming conventions (Yeast)
: All S. cerevisiae ORF's are designated by a symbol consisting of three
: uppercase letters followed by a number and then another letter, as follows:
: Y (for "Yeast"); A - P for the chromosome upon which the ORF resides (where
: "A" is chromosome I, up to "P" for chromosome XVI); L or R (for Left or
: Right arm); a 3-digit number corresponding to the order of the open reading
: frame on the chromosome arm (starting from the centromere and counting out
: to the telomere); and W or C for whether the open reading frame is on the
: "Watson" or "Crick" strand (where "Watson" runs 5' to 3' from left telomere
: ...........................

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作者  kokolu (岁月如歌), 信区: Bioinformatics                                
标题  Re: C跟W是什么意思？                                                   
时间  北大未名站 (2003年10月23日16:20:15 星期四), 转信                       
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不过 左右 和 长臂短臂的对应关系还是没有说清楚啊。
left ----- 长臂   right----短臂  
or 相反？？？？

【 在 lylover (阅读R文档ing&思念cinderella) 的大作中提到: 】
: watson是从左向右，crick是从右向左了/hehe .